L'Incubatore di Imprese Centro Storico è un'iniziativa del Comune di Genova (Assessorato Sviluppo economico e lavoro) che tramite l'Ufficio Politiche Promozione di Impresa, svolge un ruolo di coordinamento, delle relazioni tra Incubatore e Uffici comunali e con altre enti e soggetti territoriali. Job Centre è una società consortile senza scopo di lucro, partecipata dall'amministrazione comunale e dalla Federazione Regionale Solidarietà e Lavoro, gestisce l'Incubatore ed è responsabile della gestione tecnica e organizzativa della struttura. FI.L.S.E s.p.a., la finanziaria della Regione Liguria, supporta l'Incubatore nella definizione delle modalità attuative e nella definizione di bandi pubblici; gestisce inoltre le agevolazioni finanziarie per le imprese selezionate dall'Incubatore.
Ri.geNova s.r.l., società partecipata del Comune di Genova, supporta l'Incubatore in merito agli aspetti immobiliari; contribuisce ad individuare di proprietari privati e acquisisce locali, in vendita sul mercato, per metterli a disposizione dell'Incubatore. Le Associazioni di categoria contribuiscono ad iniziative mirate e specialistiche (formazione, promozione, marketing) a favore degli aspiranti imprenditori.
Il Consiglio di Circoscrizione Genova est, competente per territorio, promuove, insieme all'Incubatore, iniziative di animazione economica e territoriale e, su richiesta, esprime indicazioni in merito all'opportunità di insediamento di particolari attività d'impresa.